Software

MAHAMRU BRIN HPC menggunakan environment module untuk manajemen software. Gunakan perintah module load $nama_module untuk menggunakan module yang ada. Berikut ini beberapa software (module) yang telah tersedia. Pengguna juga dapat melakukan instalasi atau kompilasi software secara mandiri dengan tools atau  libs yang ada.

 

boost/1.76.0    dimemas/5.4.2    extrae/3.7.0    imb/2019.6    omb/5.8    scalasca/2.5  scorep/6.0    sionlib/1.7.4    tau/2.29

impi/2021.5.1    likwid/5.0.1    metis/5.1.0    mpich/3.4.2-ofi    mpich/3.4.2-ucx    mvapich2/2.3.6    openblas/0.3.7    openmpi4/4.1.1 (L)    pdtoolkit/3.25.1    superlu/5.2.1

EasyBuild/4.5.0    autotools (L)    cmake/3.21.3    gnu9/9.4.0 (L)    hwloc/2.5.0 (L)    intel/2022.0.2    libfabric/1.13.0 (L)    ohpc (L)    os    papi/5.7.0    prun/2.2 (L)    ucx/1.11.2 (L)    valgrind/3.18.1

compiler-rt/latest          compiler-rt32/latest          compiler/latest          compiler32/latest          debugger/latest             dev-utilities/2021.5.2 (D)    init_opencl/2022.0.2    mkl/2022.0.2   (D)    mkl32/2022.0.2 (D)    oclfpga/2022.0.2    tbb/2021.5.1 (D)

compiler-rt/2021.2.0        compiler-rt32/2021.2.0        compiler/2021.2.0        compiler32/2021.2.0        debugger/2021.5.0    (D)    icc/2022.0.2                  mkl/latest              mkl32/latest          mpi/latest            tbb/latest

compiler-rt/2022.0.2 (D)    compiler-rt32/2022.0.2 (D)    compiler/2022.0.2 (D)    compiler32/2022.0.2 (D)    dev-utilities/latest        icc32/2022.0.2                mkl/2021.2.0            mkl32/2021.2.0        mpi/2021.5.1   (D)    tbb/2021.2.0

blas/3.8.0   (3.8)    fftw/2.1.5        (2.1)           fftw/3.3.8 (D:3.3)    gsl/2.7              hdf5/1.10.4   (D:1.10)    lapack/3.6.1 (3.6)    lapack/3.8.0 (3.8)      libpng/1.6.34 (1.6)    netcdf/4.7.1 (D:4.7)    scalapack/2.0.0    scalapack/2.0.2 (D)      weka-3.8.3          zlib/1.2.11 (1.2)

ffmpeg/4.2.2 (4.2)    fftw/3.3.8-shared (3.3-shared)    gdal/3.1.2 (3.1)      hdf5/1.8.20 (1.8)    jasper/2.0.14 (2.0)       lapack/3.7.1 (3.7)    lapack/3.9.0 (D:3.9)    netcdf/4.1.3  (4.1)    proj/7.1.0   (7.1)      scalapack/2.0.1    tiff/4.1.0      (4.1)    weka-dl4j-1.5.13

R/3.4.4 (3.4)    WPS/4.1                 anaconda/2-2019.03    anaconda/3-tf2        autoconf/2.69 (D)       cmake/3.4.3  (D:3.4)    emacs/28.1                gcc/4.9.4  gromacs/2020.3-gpu  (D)            lammps/20.03.03-gpu (20.03-gpu)    namd/2.14        openmpi/4.0.1       (D:4.0)    python/2.7.15                  sbt/1.2.1     (1.2)

R/3.5.1          WRF/4.1.2      (4.1)    anaconda/3-cpu        anaconda/3-x          automake/1.13 (D)       cmake/3.10.3 (3.10)     gamess/00                 gcc/6.2.0          java/1.8.0.281      (1.8)          lammps/20.10.29     (D:20.10)      ncl/6.6.2     (6.6)    openssl/1.0.2       (1.0)      python/3.6.6-shared            sqlite/3.32.3 (3.32)

R/3.5.3 (3.5)    amber/20                anaconda/3-dp4-ai     anaconda/3-pytorch    automake/1.15           cmake/3.13.2            gcc/4.8.2        (4.8)    gcc/7.3.0       julia/1.5.4         (1.5)          mpich/3.1.4         (3.1)          openmpi/2.1.3 (2.1)    phase0/2014.03                 python/3.6.6        (3.6)      tinker/8.7.2  (8.7)

R/3.6.0 (3.6)    anaconda/2-cpu          anaconda/3-nlp        anaconda/3            bazel/0.16.1  (0.16)    cuda/8.0                gcc/4.8.5                 gromacs/5.1.2      ksh/93    mpich/3.2.1         (3.2)          openmpi/3.0.2 (3.0)    python/2.7.6-shared            qe/6.4.1            (6.4)      yasm/1.3.0    (1.3)

R/4.0.4 (D)      anaconda/2     (D)      anaconda/3-tf1        autoconf/2.64        cmake/2.6.0   (2.6)     cuda/9.1     (D)        gcc/4.9.4-shared          gromacs/2019.6-gpu (2019.6)    lammps/20.03.03-cpu (20.03-cpu)    mpich/3.3.0         (D:3.3)        openmpi/3.1.1 (3.1)    python/2.7.6        (D:2.7)    qe/7.0.0           (D:7.0)

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